Entgegen verbreiteten Vorstellungen ist der Jura nicht ein Bergkanton. Nur die Freiberge liegen auf 1000 m ü.M., die Bezirke Delémont und Porrentruy gehören dagegen zum Flachland und haben ein sehr mildes Klima. Boncourt ganz im Norden liegt sogar am tiefsten Punkt der Westschweiz, auf 364 m ü.M.